Schilddrüsenhormon kann eine Unterfunktion ausgleichen und das Wachstum der Schilddrüse hemmen. Neben reinen T4 Präparaten gibt es auch Kombinationspräparate (T4 und T3), die im Einzelfall oft besser vertragen werden.

Thyreostatika sind Medikamente, die die Schilddrüsenfunktion hemmen und werden zur Behandlung bei verschiedenen Erkrankungen, die eine Überfunktion verursachen, eingesetzt. Manchmal ist auch die zusätzliche Gabe von Betablockern notwendig, um das Herz-Kreislaufsystem zu bremsen.

Selen und eventuell auch Antioxydantien können sich günstig auf das Autoimmunsystem auswirken.